但都有自己独立的法人。这两个单位能否参与同一标段的投标？

如果招标公告对此没有明确要求的，具有法人资格且符合招标公告条件的公司，可以进行投标。
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投标人能否投标得看相关投标是否依照法律法规进行投标，根据《中华人民共和国招标投标法》规定，投标人应当具备承担招标项目的能力；国家有关规定对投标人资格条件或者招标文件对投标人资格条件有规定的，投标人应当具备规定的资格条件。投标人应当按照招标文件的要求编制投标文件。投标文件应当对招标文件提出的实质性要求和条件作出响应。招标项目属于建设施工的，投标文件的内容应当包括拟派出的项目负责人与主要技术人员的简历、业绩和拟用于完成招标项目的机械设备等。投标人应当在招标文件要求提交投标文件的截止时间前，将投标文件送达投标地点。招标人收到投标文件后，应当签收保存，不得开启。投标人少于三个的，招标人应当依照本法重新招标。在招标文件要求提交投标文件的截止时间后送达的投标文件，招标人应当拒收。
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招标投标一般分招标、投标、开标验标以及评标定标等阶段。